GPCR-I-TASSER是一种用于预测G蛋白偶联受体三维结构的计算方法。输入的预测序列首先提交给LOMETS（上文介绍过）用于找寻同源结构。如果同源模板找到了，那么就进行基于模板的碎片重组程序进行模型构建。如果没有找到同源模板，利用ab initio TM-helix folding程序从头组装7次跨膜螺旋束，然后进行GPCR-I-tasser结构重组模拟。最后的结构经由FG-MD（上文提过）工具优化。GPCR-I-TASSER只适用于G蛋白偶联受体结构的预测，一般蛋白的预测一般选用I-TASSER。
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